Sin embargo, sus actuaciones más destacadas fueron en la Liga disputando treinta y siete partidos y marcando veinte goles (goleador del equipo y tercero de la liga). Después de este título hubo una sequía de 2 años, durante este período , el Kun fue máximo goleador de la Premier League con 26 goles( en la temporada 2014/15) y llegó a las semifinales de la Champions League (en la temporada 2015/16).Ganó 2 Copas de la liga de Inglaterra( en 2016 y 2018), ganó su tercera Premier League en 2018 y su segunda Community Shield en 2018. En octubre de 2017, Agüero se convirtió en el máximo goleador del Manchester City con 178 goles. El 8 de enero de 2012 debutó, también anotando un gol, en la FA Cup en la derrota por dos a tres ante el Manchester United en el partido correspondiente a la tercera ronda en la que su club quedó eliminado.
En la Community Shield hizo un doblete contra el Chelsea, además en este partido logró su gol 200 en el City. Cataluña. Antes de este encuentro se jugará la final para el título del prt mer Campeonato de España, femenino en- tra el Español y el Real Madrid, partido ¡ Tal es el grado de temor a este grupo que «muchos padres con hijas adolescentes bajan a buscarlas a la calle cuando vuelven de fiesta por la noche». El castigo llevó lágrimas a los ojos del Kun, tal como lo registraron las cámaras de televisión. Por la Copa del Rey, el Atlético cayó en octavos de final frente al Barcelona, con apenas una participación del delantero argentino. Durante la temporada 2006-07 en el Atlético disputó los cuarenta y dos partidos oficiales de su equipo, veintisiete de ellos como titular, marcando siete goles. El 17 de septiembre tuvo su primera oportunidad como titular, en la visita al Athletic Club. Es que, después de Boca, solo restaba la visita a Rosario Central y Sergio, de no ser convocado al Mundial, era un candidato firme para representar a la Argentina en el Torneo Esperanzas de Toulon, lo que le impediría estar presente en la última fecha.
Fue en la visita del Barcelona, por la vigésimo sexta fecha de Liga. Por Liga debutó ante Málaga el 31 de agosto. El 16 de febrero de 2012 debutó en los dieciseisavos de final de la Europa League (competición a la que el Manchester City había accedido producto de su eliminación de la Liga de Campeones), de nuevo, anotando un gol. Mourinho viajó a Manchester el jueves con su agente, Jorge Mendes, camisetas de futbol baratas tras cerrar las conversaciones con el vicepresidente del club Ed Woodward. Bienvenidos al derbi de Mánchester, al primer duelo entre Jose Mourinho y Pep Guardiola en la Premier. Nápoles y el 18 de octubre consiguió su primer gol en esta competición con la camiseta del City. Sergio saltó al campo en el minuto 78 cuando el marcador era de empate a uno frente al Oporto y en el minuto 85 consiguió el gol que hizo el definitivo uno a dos.
Sergio debutó oficialmente con la camiseta del Atlético de Madrid el 27 de agosto de 2006, en la victoria de su equipo 1-0 como visitante frente al Racing de Santander, por la primera fecha de Liga. Sergio comenzó el partido correspondiente a la cuarta jornada de la fase de grupos en el banquillo pues volvía a una convocatoria después de superar una lesión. Su gol sirvió para conseguir los tres puntos finalizando el partido con cero a uno. Entró al campo en el minuto 62 sustituyendo, de nuevo, a Nigel de Jong cuando el marcador mostraba un empate a uno en casa frente al Villarreal y en el último suspiro del partido, cuando ya pasaban unos segundos de los tres minutos añadidos por el árbitro, Agüero empujó al fondo de la portería un centro de Pablo Zabaleta prolongado por David Silva poniendo el definitivo dos a uno en el marcador. Ye»? -Pues mire: uno tiene siete años otro cinco y otro tres. A domicilio, el Southampton tiene un balance de dos victorias, camiseta manchester city dos derrotas y un empate en cinco partidos jugados.